Сергей Серегин ушел из жизни внезапно – спустя несколько дней после госпитализации. "Чудовищно, несправедливо рано", – так охарактеризовал его смерть представитель киностудии, с которой режиссер много сотрудничал.
Самыми известными и популярными работами Серегина на экране стали полнометражные мультипликационные фильмы "День рождения Алисы" и "Тайна Сухаревой башни", а также короткометражные ленты "Белолобый", "Лукоморье. Няня", "Ключи от времени" и другие.
Кроме того, Сергей Серегин занимался развитием индустрии, в которой работал. Он стоял у истоков фестиваля детской анимации "Жар-птица" в Новосибирске, придумал программу "Утренняя зарядка" для Суздальского фестиваля. По инициативе режиссера заработал сайт "Аниматор.ру".